O Conselho de Administração do IEF é regido pela Lei nº 21.972, de 21 de janeiro de 2016, pelos artigos 7º, 8º, 9º e 10 do Decreto nº 47.344, de 23 de janeiro de 2018 e pela Deliberação nº 1526, de 14 de agosto de 2013. Tem caráter consultivo, normativo e deliberativo, é unidade de administração superior do Instituto Estadual de Florestas, e integra o Sistema Estadual de Meio Ambiente e Recursos Hídricos - SISEMA.
